醋酸钾 DNA 提取方案
材料准备
1. **试剂**:醋酸钾(Potassium Acetate)、冰醋酸(Glacial Acetic Acid)、蒸馏水(Distilled Water)、乙醇(Ethanol)、异丙醇(Isopropanol)、Tris - EDTA(TE)缓冲液等。
2. **器材**:离心机(Centrifuge)、移液器(Pipette)及配套枪头(Pipette Tips)、离心管(Centrifuge Tubes)、水浴锅(Water Bath)、电泳仪(Electrophoresis Apparatus)、凝胶成像系统(Gel Imaging System)等。
操作步骤
1. **细胞裂解**
- 将待提取 DNA 的样本(如细胞悬液)转移至合适的离心管中,以适当转速(如 5000 rpm)离心数分钟,弃去上清液,收集细胞沉淀。
- 向沉淀中加入适量裂解液(如含有蛋白酶 K 的裂解缓冲液),充分混匀,使细胞裂解。将离心管置于 37℃水浴锅中孵育一段时间(如 30 分钟),以促进蛋白质的消化。
2. **醋酸钾处理**
- 准备醋酸钾溶液,通常按照一定比例(如 5M 醋酸钾:冰醋酸:水 = 60:11.5:28.5 的比例配制)。
- 向裂解后的溶液中加入适量配制好的醋酸钾溶液,轻轻颠倒混匀,此时会观察到溶液中出现白色沉淀。这是因为醋酸钾与蛋白质、多糖等杂质结合形成沉淀,而 DNA 则留在上清液中。
- 将离心管在冰上放置数分钟(如 10 分钟),以促进沉淀的形成。然后以较高转速(如 12000 rpm)离心 10 - 15 分钟。
3. **上清液转移与核酸沉淀**
- 小心吸取离心后的上清液,转移至新的离心管中,注意不要吸取到沉淀。
- 向上清液中加入适量的异丙醇(一般为上清液体积的 0.6 - 1 倍),轻轻颠倒混匀,此时可见白色丝状的 DNA 析出。
- 将离心管在室温下放置数分钟(如 5 - 10 分钟),然后以 12000 rpm 离心 5 - 10 分钟,使 DNA 沉淀在管底。
4. **洗涤与干燥**
- 弃去上清液,向含有 DNA 沉淀的离心管中加入适量 70%乙醇,轻轻洗涤 DNA 沉淀,以去除残留的杂质和盐分。
- 再次以 12000 rpm 离心 2 - 3 分钟,弃去乙醇,将离心管倒扣在干净的吸水纸上,让残留的乙醇自然挥发,使 DNA 沉淀干燥。注意不要过度干燥,以免 DNA 难以溶解。
5. **DNA 溶解**
- 待 DNA 沉淀干燥后,向离心管中加入适量的 TE 缓冲液(或蒸馏水),轻轻吹打或振荡,使 DNA 充分溶解。可将离心管置于 37℃水浴锅中孵育数分钟,以加速溶解。
6. **质量检测**
- 取适量溶解后的 DNA 溶液,通过琼脂糖凝胶电泳(Agarose Gel Electrophoresis)进行检测。配制合适浓度的琼脂糖凝胶(如 1% - 2%),加入核酸染料(如 EB 或 SYBR Green),将 DNA 样品与上样缓冲液混合后上样。
- 在合适的电压下进行电泳,电泳结束后,通过凝胶成像系统观察 DNA 的条带情况,判断 DNA 的完整性和纯度。同时,可通过紫外分光光度计测定 DNA 溶液在 260 nm 和 280 nm 处的吸光度,计算 A260/A280 的比值,评估 DNA 的纯度,理想的比值应在 1.8 - 2.0 之间。
注意事项
1. 操作过程中应尽量轻柔,避免剧烈振荡,防止 DNA 断裂。
2. 所有试剂应保持纯净,避免污染,移液器枪头应每次更换,防止交叉污染。
3. 乙醇洗涤后干燥 DNA 沉淀时,注意控制干燥时间,避免 DNA 过于干燥而难以溶解。
4. 在进行电泳检测时,注意设置合适的电压和时间,以获得清晰的 DNA 条带。